南京市軟科學研究計劃項目的申報方式是網上填報與書面報送結合。需要在市科委網站“科技計劃管理系統”注冊申報。申報材料提交后及時關注科委在系統中的反饋信息，獲科委審核通過后，用word軟件打開自動生成的文件并打印正式申報書面材料，按要求裝訂報送社科處。關于南京市軟科學研究計劃項目申報條件的具體內容如下：
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南京市軟科學研究計劃項目申報條件：
1.重點項目申報單位為政府部門、企事業單位、社會組織等。一般項目申報單位必須為政府部門、事業單位。鼓勵項目申報單位與有關方面聯合，共同組成研究團隊。與協作單位共同申報項目的申報單位應當與協作單位簽訂共同申報合作協議，協議書作為附件一并提交。
2. 重點項目10個課題，每個課題同一申報單位限報1項，同一申請人限報1個課題。一般項目每個申報單位原則上每個研究方向只能申報1項。承擔往年南京市軟科學研究計劃項目尚未結題及連續3年獲得立項的項目負責人，均不得參加本次項目申報。申報單位軟科學研究歸口管理部門應做好審核把關工作，規范授權程序。未經申報單位軟科學研究歸口管理部門同意的項目申報，視為無效。
3.申報項目應具有創新性和時效性，研究工作須在項目下達半年內完成。申報單位應同意其獲立項支持的軟科學研究成果由市科委在網站上向社會公布。重點項目作者享有署名權，著作權的其他權利由市科委享有。